생물정보연구소 https://bioinfo.snu.ac.kr 생명공학공동연구원 생물정보연구소 <![CDATA[KSMCB 2026 정기학술대회]]> [2026 정기학술대회 주요 일정 안내]   • 학술대회 일시: 2026년 10월 5일(월) - 8일(목)   • 학술대회 장소: 대전컨벤션센터(DCC)   • 포스터 초록 제출 마감: 2026년 9월 22일(화)까지 (※ 추가 연장 불가)    * 우수포스터 신청 마감: 2026년 8월 28일(금)까지   • 사전 등록 마감: 2026년 9월 22일(화)까지   • 등록 방법: 학회 홈페이지(https://www.ksmcb.or.kr/icksmcb2026/main.html#n) 접속 후 로그인 ➔ 사전 등록/초록 제출 메뉴 이용]]> Thu, 03 Sep 2026 11:17:44 +0000 <![CDATA[2026 Single-Cell Systems Biology SBM Workshop]]>
생물정보연구소에서 주관하는 2026 Single-Cell Systems Biology SBM Workshop을 아래와 같이 진행합니다.
이번 워크샵에서는 single-cell sequencing을 비롯하여
scRNA-seq , cell-type annotation, trajectory inference, single-cell multi-omics, spatial transcriptomics 등 
시스템 생물학 및 생물정보 관련 주제로 세션을 진행할 예정입니다.
 
> 행사 일정
  • 일시: 2026년 8월 28일(금) ~ 8월 29일(토)
  • 장소: 강원특별자치도 홍천군 한치골길 262 소노호텔앤리조트
  • 주제: From sequencing reads to cellular ecosystems
> 주요 프로그램
  • Experimental design & single-cell sequencing
  • scRNA-seq preprocessing & quality control
  • Cell-type annotation & trajectory inference
  • Single-cell multi-omics integration
  • Spatial transcriptomics & cell–cell communication
 
기타 문의사항은 z023719@snu.ac.kr 로 문의주세요.
 
감사합니다. 
]]> Thu, 20 Aug 2026 15:01:34 +0000 <![CDATA[남한강 컨퍼런스 하계 워크숍]]> "남한강 컨퍼런스 하계 워크숍" 남한강컨퍼런스는 단백체학 연구의 국내 동향과 혁신 기술을 공유하고, 연구자 간 협력을 강화할 것이며,연구자들이 단백체 연구 분야의 최신 성과를 발표하고 토론할 수 있는 장을 마련하여 질병 진단, 치료 및 바이오 기술 발전에 기여하고자 워크숍을 개최합니다. 
  • 일시: 2028.08.10(월)~11(화)  
  • 장소: 통영 
  • 주관: 서울대학교 생물정보연구소/단백체데이터 품질선도센터
]]> Mon, 10 Aug 2026 15:20:07 +0000 <![CDATA[제2회 한국분자·세포생물학회 미래컨퍼런스]]> Wed, 17 Jun 2026 14:14:37 +0000 <![CDATA[2026 제39회 설악학술대회]]> 서울대학교생물정보연구소|순천향대학교G-LAMP사업단| 연세대학교국가연구소(NRL2.0)사업단|유전체사업단(GeMC)| 이화여자대학교멀티태스킹대식세포연구센터|인제대학교 심혈관대사질환센터|조선대학교G-LAMP사업단]]> Wed, 17 Jun 2026 14:10:03 +0000 <![CDATA[KSBMB International Conference 2026]]> Wed, 17 Jun 2026 14:06:57 +0000 <![CDATA[생물정보연구소 2026 Spring SBM Workshop]]> 안녕하세요
 
서울대학교 생물정보연구소에서 AI for Precision Medicine: Integrating EHR and Multi-Omics Data 를 주제로 " 생물정보연구소 2026 Spring SBM Workshop"을 아래와 같이 진행합니다. 
 
일시: 2026  3월 13일 - 14일
장소: 대부도
 
첫째날 점심, 저녁식사와 숙소, 둘째날 점심이 제공될 예정입니다.
많은 관심과 참여 부탁드립니다.
 
기타 문의사항은 mini0229@snu.ac.kr, z023719@snu.ac.kr 로 문의주세요.
 
감사합니다. 
]]> Fri, 06 Mar 2026 14:32:53 +0000 <![CDATA[From Gene to Protein: Applications in Clinical Research and Precision Medicine workshop]]> Mon, 19 Jan 2026 15:04:32 +0000 <![CDATA["2025년 한국분자 • 세포생물학회 에피유전체학분과 심포지엄" 개최 안내]]> Fri, 05 Dec 2025 12:04:41 +0000 <![CDATA[생물정보연구소 2025 Fall SBM Workshop]]> 안녕하세요
 
서울대학교 생물정보연구소에서 Decoding Cellular Heterogeneity: From Single-cell to Spatial Transcriptomics 를 주제로 " 생물정보연구소 2025 Fall SBM Workshop"을 아래와 같이 진행합니다. 
 
일시: 2025  9월 19일 - 20일
장소: 대부도
 
첫째날 점심, 저녁식사와 숙소, 둘째날 점심이 제공될 예정입니다.
많은 관심과 참여 부탁드립니다.
 
기타 문의사항은 mini0229@snu.ac.kr, z023719@snu.ac.kr 로 문의주세요.
 
감사합니다. 
]]> Thu, 11 Sep 2025 12:29:09 +0000 <![CDATA[[한국분자세포생물학회] 2025 정기학술대회]]> Wed, 03 Sep 2025 15:08:37 +0000 <![CDATA[2025 AI-DRIVEN BIOINFORMATICS WORKSHOP]]> https://snu-ac-kr.zoom.us/j/83551203365 ID: 835 5120 3365]]> Tue, 15 Jul 2025 13:08:10 +0000 <![CDATA[제1회 한국분자 세포생물학회 미래컨퍼런스]]> Thu, 10 Jul 2025 15:10:21 +0000 <![CDATA[제17회 2025 남한강 컨퍼런스]]> 제17회 2025 남한강 컨퍼런스 를 아래와 같이 개최하오니 많은 관심 부탁드립니다.  일시 : 2025.02.14 [Fri] ~ 15 [Sat]                 장소 : 광주과학기술원 오룡관 101호 주최 : 고려대학교 유전단백체연구센터/단백체데이터품질선도센터, 서울대학교 생물정보연구소, 써모 피셔 사이언티픽 코리아  * 프로그램 첨부 ]]> Tue, 11 Feb 2025 09:47:51 +0000 <![CDATA[2025 치매 저항성 연구워크샵]]> "치매 저항성 연구워크샵" 치매 및 관련 신경퇴행성 질환 분야의 국내외 최신 연구 동향을 파악하고, 다양한 연구 기법 및 기술을 공유할 수 있는 전문 학술 활동의 장을 마련함으로써, 치매 저항성 연구 분야의 학문적 발전과 산업적 응용을 도모하고자 하기위하여 워크샵 개최를 하오니 많은 관심 부탁드립니다.
  • 일시: 2025.01.23(목) 14:00~18:00
  • 장소: 서울대학교 목암홀
  • 주관: 서울대학교 생물정보연구소
]]> Tue, 21 Jan 2025 14:14:33 +0000 <![CDATA[2025 생물정보연구소 Winter SBM 워크샵]]> 안녕하세요, 
 
서울대학교 생물정보연구소에서 Advances in Deep Learning for Precision Medicine 를 주제로 "2025 생물정보연구소 Winter SBM 워크샵"을 아래와 같이 진행합니다. 
 
 
일시: 2025 1월 16일 - 17일
장소: 대부도 랜드마크원
 
일시: 1월 16일 -17일
장소:  경기도 안산시 단원구 부흥로 287-228
 
첫째날 점심, 저녁식사와 숙소, 둘째날 점심이 제공될 예정입니다.
 
많은 관심과 참여 부탁드립니다.
 
기타 문의사항은 youngjinna@snu.ac.kr, z023719@snu.ac.kr 로 문의주세요.
 
감사합니다. 
 
 
]]> Tue, 21 Jan 2025 14:02:20 +0000 <![CDATA[2025 유전체 심포지엄]]> Tue, 21 Jan 2025 13:58:28 +0000 <![CDATA[제4회 생물정보학데이 개최 안내]]> 일시 : 2014. 10. 10.(금) 10:00~16:30 장소 : 서울대학교 박물관 강당   초대의 글  최근 눈부신 발전을 거듭한 유전체 기술로 인하여 생물정보학의 필요성이 증대하였고, 연구 관심도가 높아지고 있습니다. 이에 생물정보학 협동과정과 생물정보연구소에서는 공동으로 생물정보학데이를 매년 개최하고 있습니다.  본 행사는 생물정보학에 관심이 있는 학부 학생 및 대학원생, 연구자들을 대상으로 관련 학문의 전반적 소개와 현재 생물정보학의 분야별 트렌드를 공유하고자 마련한 자리입니다.    특히 올해는 한국연구재단에서 추진 중인 유전체 미래 원천기술개발 사업의 일환으로 차세대 유전체 및 생명정보 분야의 전문인력을 양성을 통한 국가 생명공학 연구기반의 강화 및 관련 연구활성화를 위한 “BIT 융합 연계교육 시스템 구축사업”과 연계된 BIT 융합교육 협의회 워크샵으로 진행하고자 합니다.  BIT 융합교육 협의회는 서울대학교(책임자:김선 교수), 이화여자대학교(책임자:이상혁 교수), 숭실대학교(책임자:김상수 교수), 한양대학교(책임자:고인송 교수) 등 네 개 대학을 주축으로 생물 및 IT 연구 분야에서 생물정보학 연구를 수행하고 있는 교육기관으로 구성되어있습니다.   이번 생물정보학데이를 통하여 각 대학에서 모든 생물 관련한 연구에 대해 정보를 나눔으로서 연구 역량을 높이는 기회를 가질 수 있도록 생물정보학에 관심 있는 여러분의 참여를 바랍니다. 바쁘시더라도 부디 참석하시어 뜻 깊은 시간을 나누는 자리가 될 수 있도록 관심 부탁드립니다.   생물정보학 협동과정 전공주임 천종식 생물정보연구소 소장 김선   문의사항 : Tel. 02-880-9023/2859 e-mail. ipbi@snu.ac.kr   주최 : 서울대학교 생물정보연구소, (협)생물정보학전공, 생명공학공동연구원 주관 : 서울대학교 BIT 융합교육센터, 이화여자대학교 시스템생물학연구소, 숭실대학교 의생명시스템학부, 한양대학교 BIT 융합교육센터 후원 : 한국연구재단, BIT 융합 연계교육시스템 구축사업 교육연계협의회]]> Wed, 11 Dec 2024 11:08:02 +0000 <![CDATA[실험 및 문헌정보 거대 복잡형 데이터 통합분석추론 연구]]> [실험 및 문헌정보 거대 복잡형 데이터 통합분석추론 연구]

생명과학 연구의 패러다임이 가설 중심 연구에서 데이터 중심 연구로 변화하였음. 측정 장비의 발달로 인해 실험 및 문헌정보 데이터는 다양한 종류와 방대한 양을 지닌 “거대 복잡형 데이터(Big Complex Type Data)”를 형성함. 고차원 범주(Highly multi class), 초고차원 속성(Extremely high dimensional attribute), 이질적 타입(Heterogenous type)의 특징을 지닌 “거대 복잡형 데이터”는 기존의 데이터마이닝 기술로는 분석이 어려움. 해당 연구에서는 네트워크 마이닝과 문헌정보 지식 추출 기술을 활용하여 “거대 복잡형 데이터”통합분석추론 원천기술 개발을 목표로 함. 이를 통해 차세대 정보 분석 분야의 국가 기술력을 제고하고, 정밀 의학 실현 토대 마련 등의 생명과학 분야에 활용하여 경제적․산업적 부가가치를 창출하도록 함. <연구목표>

○ 1단계: 네트워크와 문헌정보 추론을 통한 실험 및 문헌정보 “거대 복잡형 데이터” 지식베이스 추출 및 구축

A. 실험 “거대 복잡형 데이터” 통합 네트워크 구축

1) 개별 실험 데이터를 활용한 개별 계층 네트워크 구축

2) 개별 실험 데이터 간 연관성 분석을 통한 실험 “거대 복잡형 데이터” 통합 네트워크 구축

B. 문헌정보 “거대 복잡형 데이터” 기반 통합 지식베이스 구축

1) 생명의료 객체-관계 데이터 생성을 위한 딥러닝 기반 지식추출 방법 개발

2) 기존 생명의료 관련 지식베이스와 문헌기반 네트워크 통합 지식베이스 구축

C. “거대 복잡형 데이터” 네트워크 기반 지식베이스로부터 객체 간 관계 규칙 추출 기술 개발

1) 정규 패스 표현을 위한 그래프 데이터베이스 기반의 고속 귀납적 학습

2) 정규 패스 표현을 위한 그래프 데이터베이스 기반의 병렬 귀납적 학습

○ 2단계: 실험 및 문헌정보 “거대 복잡형 데이터” 네트워크 통합분석추론 원천 기술 개발

A. 실험 “거대 복잡형 데이터” 네트워크 통합분석추론을 위한 원천 기술 개발

1) 실험 데이터 통합분석추론을 통한 네트워크 바이오마커 발굴 기술 개발

2) 통합 네트워크를 활용한 유사 네트워크 비교 및 군집화 기술 개발

B. 문헌정보 “거대 복잡형 데이터” 네트워크 분석 기술을 이용한 통합 추론 시스템 및 약물 반응 예측 시스템 구축

1) 문헌정보 통합분석추론을 통한 네트워크 바이오마커 발굴 기술 개발

2) 약물 반응성 예측 및 약물 추천 원천 기술 개발

C. “거대 복잡형 데이터” 통합 네트워크 지식베이스를 이용한 지식 통합분석추론 기술 개발

1) 지식베이스를 이용한 지식 통합분석추론 기술

2) 지식 통합분석추론 기술의 병렬화

사사표기안내:NRF-2017M3C4A7065887 <참여연구원>

분 야 직 위 (직명) 성 명 소속부서 전공 및 학위
학위 년도 전공 학교
Bioinformatics 교수 김선 서울대학교 박사 1997 컴퓨터학 Univ. of Iowa
  교수 강재우          
  교수 한욱신        

 

]]> Mon, 09 Dec 2024 16:34:01 +0000 <![CDATA[고정밀 암 진단을 위한 멀티오믹스 기반 유전체변이 발굴 및 진단용 소프트웨어 플랫폼 개발]]> [고정밀 암 진단을 위한 멀티오믹스 기반 유전체변이 발굴 및 진단용 소프트웨어 플랫폼 개발] 본 연구에서는 고정밀 암 진단을 위한 멀티오믹스 유전체변이 발굴 및 진단용 소프트웨어 플랫폼을 개발하고자 함. 본 소프트웨어는 WGS(whole genome sequencing), WES(whole exome sequencing) 및 WTS(whole transcriptome sequencing) 데이터로부터 SNV(single nucleotide variation), small indel(insertion and deletion), CNA(copy number alteration), 염색체구조변이(structural variation), 융합유전자(fusion gene)를 세계 최고수준의 검출 정확도로 검출하는 것을 목표로 함. 고효율의 계산 성능을 확보하기 위해 병렬 및 분산처리 알고리즘을 적극 활용하며, 개발 결과는 해당분야 상위10%급 저널에 출판하고, 임상 적용 및 사업화를 추진하고자 함. <연구목표>
□ 고정밀 암 진단을 위한 멀티오믹스 유전체변이 발굴 및 진단용 소프트웨어 플랫폼 개발
  • 현재 개발 중인 SNV 및 small indel 검출 알고리즘의 성능개선 및 최적화 수행
  • CNA 검출을 위한 고정밀 알고리즘 개발
  • 정확한 normal contamination 검출을 통한 SNV, small indel, CNA, 구조변이 검출 정확도 개선
  • Coding/noncoding 변이들의 기능 annotation 및 druggable 변이를 발굴하는 진단 알고리즘 개발
  • 고성능 드노보 어셈블리인 FSSEMBLER를 개발하여 구조변이, 융합유전자 예측 성능 향상
  • Unmapped WTS 데이터의 드노보 어셈블리와 CNA와 Normal Contamination을 고려하는 융합유전자 예측 및 WGS 데이터와 통합 분석 프로그램 개발
 
□ 병렬/분산처리 알고리즘을 적극 활용하여 고효율의 계산 성능 확보
  • SNV, small indel 및 CNA 검출 알고리즘과 coding/noncoding 변이 annotation/진단 도구의 계산 효율 개선
  • FSSEMBLER 개발 과정에서 분산 병렬화 코드화 협업으로 고효율 프로그램 개발
  • 연산자원 활용 극대화를 위한 동적스케줄링 기법 개발 및 적용
 
□ 유전체변이 발굴 및 진단용 소프트웨어 플랫폼 완성하고 성능 검증 및 임상적용 추진
  • 성능 최적화된 알고리즘들을 병합해 하나의 소프트웨어 플랫폼으로 통합
  • 3개 이상의 기관에 개발한 소프트웨어 플랫폼을 이식해 독립적인 성능 검증
  • TCGA 데이터, 한국인 유방암/혈액암(>200예)의 WGS 데이터에 적용하여 성능 검증하고, PCR 및 Sanger Sequencing을 이용한 실험적 검증 수행
  • 오픈소스 라이센스(GPL/BSD/MIT/Apache) 및 소프트웨어 공개를 통한 검증(github).
  • 임상적용에 적합한 한국인 특이적 암 멀티오믹스 데이터 분석 시스템 표준화 및 분석 표준 지침(Standard Operation Protocol) 구축
  • 세계적 수준의 저널에 논문 출판, 해외특허 출원
  • “인허가 가이드라인 협의체” 구성 객관적 인증을 획득하며, 최종 산출물 상용화를 위한 비즈니스 모델 구축
 
[Acknowledgement] < 논문 > - 국문 표기 : “본 연구는 보건복지부의 재원으로 한국보건산업진흥원의 보건의료기술연구개발사업 지원에 의하여 이루어진 것임(과제고유번호 : HI15C3224 ).” - 영문 표기 : “This research was supported by a grant of the Korea Health Technology R&D Project through the Korea Health Industry Development Institute (KHIDI), funded by the Ministry of Health & Welfare, Republic of Korea (grant number : HI15C3224 ).”    < 특허 > - 특허 출원 시 해당 특허 창출에 기여한 국가연구개발사업의 과제정보*를 기입하도록 관련법령**에 의무화됨   * 과제정보 기재항목 : 발명을 지원한 국가연구개발사업, 과제고유번호(NTIS), 부처명, 연구관리 전문기관, 연구사업명, 연구과제명, 기여율, 주관기관, 연구기간

- 한국지식재산전략원(http://www.rndip.re.kr/) ** 관련법규 : 국가연구개발사업의 관리 등에 관한 규정 제20조 제6항,『특허법 시행규칙』 서식 14 특허출원서 <참여연구원>

분 야 직 위 (직명) 성 명 소속부서 전공 및 학위
학위 년도 전공 학교
Bioinformatics 교수 백대현          
Bioinformatics 교수 김선 서울대학교 공과대학 컴퓨터공학부 박사   Computer Science
]]> Mon, 09 Dec 2024 16:30:03 +0000