생물정보학 세미나 공지

서울대학교 생물정보연구소와 생물정보학 협동과정 공동 주최로 특별 세미나를 아래와 같이 열고자 하오니, 많은 참여 바랍니다.

 

일시: 2016. 2. 23.(화) 11:00

연사: 김상수 교수 (숭실대학교 의생명시스템학부)

장소: 25동 411호

 

Title: Phasing-based filtering of cancer somatic mutation calls in next generation sequencing

 

Abstact

One of the most important applications of the Next-Generation Sequencing (NGS) technology is the discovery of variants, either germline or somatic, from clinical samples. There are several factors that introduce uncertainty in the sequence calling based on NGS. For example, NGS has relatively higher error rate than conventional Sanger and the number of variants are usually very small compared to the number of base calls to make, requiring a highly sensitive and specific method. In this talk, I will summarize the basic concepts behind the variant calling from NGS data and discuss pros and cons of various known methods. The las part will feature our own approach to improve the variant calling quality.

 

Bio

1977~81 서울대학교 화학과 이학사

1981~83 서울대학교 화학과 이학석사

1983~86 미국 아이오와주립대학교 화학과 이학박사

1986~88 미국 퍼듀대학교 생물학과 박사후연구원

1988~00 (주)엘지화학 바이오텍연구소 책임연구원

2000~05 한국생명공학연구원 책임연구원

2003~05 국가유전체정보센터 센터장

2005~현 숭실대학교 의생명시스템학부 교수

2016~16 한국유전체학회 회장

 

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